很多省份在二者的叫法上可能不一样，有些省份可能还么有这两个整证！
但在昆明有这样的规定，小作坊备案登记证与小作坊生产许可证两者的主要区别在于性质、发放依据、适用对象及管理要求等方面：
 
1.二者的性质不同：
   昆明小作坊备案登记证：主要是对昆明地区的小规模食品生产作坊的一种备案管理制度，是监管部门对符合条件的小作坊予以登记并在政府部门备案的证明书/备案卡，表明该小作坊在政府监督下开展合法的食品生产经营活动。
   昆明小作坊生产许可证：小作坊往往不像大型食品企业那样取得正式的食品生产许可证，而是通过符合昆明法规和食品安全条例所规定的标准，获得许可或登记备案后才能从事有限范围内的食品生产活动。
2.发放依据不同：
  昆明小作坊备案登记证：依据的是云南省关于食品小作坊的管理条例，以及市场监管部门的具体规定。
   昆明小作坊生产许可证：如果有的话，其依据将是食品生产许可管理办法或者结合地方性的食品安全管理规定。
 
3.适用对象不同：
   昆明小作坊备案登记证：适用于规模较小、生产条件和经营范围有限制的个体工商户性质的小作坊。
  昆明小作坊生产许可证：可能会面向具有一定生产能力和质量控制水平的小作坊，其审查和批准的标准较备案登记更为严格。
 
4.管理要求不同：
   昆明小作坊备案登记证：持证小作坊生产的产品类别和范围受到严格限制，且通常需要定期接受检查和评估，以确保食品安全和卫生条件达到基本标准。
  昆明小作坊生产许可证：如果实行的话，将意味着更高的标准和更严谨的监管，包括但不限于生产设备、生产工艺、原料采购、产品检验、管理体系等方面的要求。
 
在昆明的实际情况中，小作坊多采用备案登记管理制度，并非普遍发放“小作坊生产许可证”，但无论是哪种形式的许可或备案，都是为了确保食品安全和规范化管理，因此千万不要无证经营，食品安全很重要。